基因上位作用指的是兩對獨立遺傳的基因共同影響一個單位的性狀，其中一對基因對另一對基因的表現有遮蓋作用。
這種遮蓋作用導致某些遺傳特徵不能表現出來。上位作用可以根據顯性和隱性基因來分類，具體為：
顯性上位作用。當上位基因（顯性或隱性）處於顯性狀態時，會遮蓋下位基因的作用，只有在上位基因處於隱性狀態時，下位基因的作用才能表現出來。
隱性上位作用。在這種情況下，一對隱性基因對另一對非等位基因的表達有遮蓋作用，只有當上位基因（隱性或顯性）處於顯性狀態時，下位基因的作用才能表現出來。
這種基因間的相互作用在遺傳學中非常重要，尤其是在研究複雜性狀的遺傳時。