填海造地的危害主要包括對海洋生態系統的破壞、土地沉降、污染物排放、海水入侵、生活垃圾處理困難、生物多樣性降低、影響潮汐和波浪條件、改變水文動力環境、海岸線形態改變、近岸和近海沉積環境與水下地形變化、社會穩定問題、漁業資源影響等。
具體來說，填海造地會破壞原有的海洋生態系統和海岸生態系統，導致大量海洋生物和陸地生物失去棲息地，造成生態平衡失調。同時，填海造地過程中會產生大量的廢氣和廢水，其中含有有害物質如二氧化碳、一氧化碳、氫氧化物等，對周圍環境造成嚴重污染。此外，填海造地還會改變海岸線，影響潮差、水流和波浪等水動力條件，導致海水入侵內陸，沿海鹽鹼化，對農業生產和生活帶來不利影響。隨著填海造地區域人口的增加，生活垃圾處理成為一個嚴重問題，導致環境污染和衛生問題。
因此，填海造地雖然短期內可能解決了某些地區的空間需求，但長期來看，其對環境和生態系統的破壞影響是深遠和不可逆的。