大堡礁是海洋生物的樂園，其中包括多種魚類、軟體動物和棘皮動物。以下是部分棲息於此的動物：
魚類：大堡礁有1500種熱帶海洋魚類，如小丑魚、蝴蝶魚、雀鯛、獅子魚、印頭魚、石頭魚、天使魚、鸚鵡魚等。
軟體動物：大堡礁海域生活着4000多種軟體動物，包括巨蛤、海蜇、海蛞蝓、海鞘、海膽、海星、海葵、蠕蟲、海綿、蝦等。
棘皮動物：大堡礁海域還生活着4000多種棘皮動物，如海蔘、海星、海葵、管蟲等。
哺乳動物：大堡礁是儒艮（海牛）和海龜的棲息地，其中海龜每年10月到次年3月會在雷恩島產卵。
鯨類：每年7-9月，瀕臨滅絕的座頭鯨會在珊瑚島南部出現，它們的體長在15米左右，體重在40噸以上。
其他動物：大堡礁還棲息着其他瀕臨滅絕的動物，如人魚（儒艮）和巨型綠龜。
以上信息展示了大堡礁豐富的海洋生物多樣性，包括多種魚類、軟體動物、棘皮動物、哺乳動物和鯨類，它們共同構成了這個世界上最大的珊瑚礁生態系統。