威斯康星州有多所知名的高等教育機構，其中威斯康星大學系統（University of Wisconsin System）占據重要地位。以下是威斯康星州部分知名大學的排名：
威斯康星大學麥迪遜分校（University of Wisconsin-Madison）：作為威斯康星大學系統的旗艦學府，該校在全球範圍內享有極高的聲譽。在2023年的QS世界大學排名中位列第83位，USNews世界大學排名為第63位，THE世界大學排名為第81位，而ARWU世界大學排名為第33位。
威斯康星大學歐克萊爾分校（University of Wisconsin-Eau Claire）：該校在2023年的排名中位列第三，提供80多個本科課程和12種研究生學位選擇。
威斯康星大學懷特沃特分校（University of Wisconsin-Whitewater）：成立於1868年，於1971年加入威斯康星大學系統。在2023年的排名中位列第六，提供50多個專業和119個輔修專業的學習項目。
此外，威斯康星州還有其他知名的學院，如勞倫斯大學（Lawrence University）和貝洛伊特學院（Beloit College），它們在各自的領域內也有很高的學術地位。