小智不讓皮卡丘進化的原因主要有以下幾點：
尊重皮卡丘的意願：小智認爲皮卡丘是他的寵物，而不是用來戰鬥的工具。在皮卡丘面對烈雀襲擊時，小智保護皮卡丘的決心感動了他，兩人成爲了好朋友和搭檔。小智尊重皮卡丘的選擇，不願意強迫它進化。
保持皮卡丘的純真：皮卡丘不願意進化，因爲它擔心進化後可能會忘記與小智的回憶，改變自己的性格。小智也理解這一點，認爲保持皮卡丘的純真是最美好的事情。
避免副作用：皮卡丘進化成雷丘雖然會大幅提升實力，但也可能帶來副作用，性格大變，甚至忘記與小智的回憶。小智不希望皮卡丘因爲進化而失去這些重要的東西。
商業考慮：經營《精靈寶可夢》的公司需要皮卡丘作爲代言人，因此不能讓皮卡丘進化。
綜上所述，小智不讓皮卡丘進化是因爲他尊重皮卡丘的意願，希望保持它的純真，避免可能的副作用，以及考慮到商業因素。