居姓的起源主要有以下幾種說法：
源於杜姓：周大夫杜伯的兒子在晉國作官，被封在先邑，他的子孫以邑為姓，稱為先姓。晉文公提拔他的後人先軫為中軍元帥，職掌國政。先軫的兒子先且居後來繼位中軍元帥，在彭衙打敗秦軍。先且居的名聲因此大增，他的子孫以他的名字中的「居」字作為姓氏，稱為居氏。
源於姬姓：出自遠古少昊思的後裔倍伐，屬於以先祖封邑名稱為氏。倍伐是古蜀國的君主，還是遠古時代君主少昊的後代。後人以他的封地作為自己的姓氏，以示對先祖的追崇。
源於媯姓：出自戰國時期齊國大夫香居，屬於以先祖名字為氏。香居，亦稱香車，是戰國時期著名的齊國王族大夫，仕從齊宣王田辟疆。香居的後人以他的名「居」作為自己的姓。
源於西夜國：出自古代西域地區的羌族分支悉居人，屬於以氏族名稱漢化為氏。悉居人，是古代西域地區的羌族人分支。他們在發展過程中，為了鞏固自己的部族，加強與中原的交流，將自己的部族名稱漢化為姓氏「居」。
居姓在中國大陸和台灣省都沒有列入百家姓前三百位，在宋版《百家姓》中排序為第三百四十六位。據《元和姓纂》記載：「晉大夫先且居之後，以王父字為氏」，「今錢塘多此姓」。居姓的分布較廣，江蘇多此姓，約占全國漢族居姓人口87%。