巴丘的地理位置存在兩種不同的說法：
湖南嶽陽說：學術界有偏向性意見認爲巴丘位於今天的湖南嶽陽市。這一觀點得到了一些學者的支持，如王前程在其論文中提到，曹操所至的巴丘不在今天的湖南嶽陽市，而是指巴丘湖，即雲夢澤，位於江陵之東，漢水之南，長江之北及西北。
江西峽江縣巴邱鎮說：中央電視臺播出的百家講壇《易中天品三國》明確指出，三國時期周瑜練兵的巴丘位於今天的峽江縣巴邱鎮。此外，《三國志·周瑜傳》記載的“還定豫章、廬陵，留鎮巴丘”的巴丘也應爲江西崇仁。
綜上所述，巴丘的位置存在爭議，一種說法是位於今天的湖南嶽陽市，另一種說法是位於今天的江西峽江縣巴邱鎮和崇仁縣。