巴拉圭河的支流包括：
貝爾梅霍河（Río Bermejo）：源出玻利維亞塔里哈（Tarija）附近，流經阿根廷，最後在巴拉圭的皮拉爾（Pilar）對面匯入巴拉圭河，全長約1,046公里。
皮科馬約河：作為巴拉圭河的一個重要支流，它與貝爾梅霍河一同構成了巴拉圭河的主要水源。
特維夸里河、庫亞巴河、塔夸里河、米蘭達河、阿帕河：這些河流也是巴拉圭河的支流，它們共同為巴拉圭河提供了豐富的水資源。
巴拉圭河是南美洲第五大河流，也是巴拉那河的主要支流。它的流量季節變化較大，其中科倫巴以上的河段汛期一般為每年1～3月份，而科倫巴以下的河段汛期一般為每年6～8月份。