《康熙字典》的注音方法主要包括以下三種：
反切法：這是《康熙字典》中使用的主要注音方法。反切法是用兩個漢字給一個字注音，第一個漢字的聲母和第二個漢字的韻母所組成的全拼，即為該字的讀音。例如，「莫交切」，就是取「莫」字拼音的聲母「M」，和「交」字拼音的韻母「iao」，所組成的一個新的全拼：Miao。
直音法：直音法是《康熙字典》中另一種注音方法。直音法就是直接用一個漢字來給另一個字注音，使得後者可以直接根據前者的讀音來理解。
葉音法：葉音法是一種不科學的注音方法，已經被認為是應當批判和否定的。
需要注意的是，《康熙字典》並沒有根據相同的字音來歸類漢字，這就需要一種我們並不熟識的注音方式來獲悉漢字的音韻，這就是反切法。