《怪異症候群2》的故事主要圍繞著一個名為東中野學園的高中，這個學校有一個名為“同人異端言語”的神秘組織，該組織會對同學們的奇怪症狀進行研究。主角諸多國久科以及部分東中野學園的同班同學由於不同原因都產生了異於常人的症狀。他們有言語錯亂的學生、痴迷於寫作業的學生、看起來喜歡撒嬌的美術老師、為了自由行動而脫離組織的可疑少女、耳朵出現了怪異症狀的轉校生等等，所有人都有著共同點：就是自己的症狀只有在這個特殊團體中才能夠理解，症狀帶來的困惑與困擾也無法用普通的醫學和心理治療方法來解決。於是這個學校的神秘組織決定成立調查組來幫助大家調查病症的根源。這個故事中的同學們需要深入調查各自的症狀、社會以及學校的環境等種種現象，他們所找到的結果將對同學們本身以及整個學校產生深遠影響。
以上信息僅供參考，如需了解更多，請查閱相關書籍或諮詢專業人士。