在《我的世界》火影忍者模組中，遊戲玩法主要圍繞使用各種忍術和探索遊戲內的各種元素。以下是《我的世界》火影忍者模組的主要玩法：
安裝MOD後，玩家可以在遊戲螢幕的左上角看到顯示查克拉量的標誌，使用忍術時會消耗查克拉。玩家可以通過按J鍵打開忍術技能樹，這裡展示了所有可用忍術，將滑鼠移動到圖示上可以查看相應介紹和組合鍵，即結印方式。
遊戲中，玩家可以使用各種忍術，比如豪火球術、水遁、土遁、雷遁等。使用忍術時，左上角的查克拉量會相應減少。查克拉可以通過自然恢復或按C鍵快速恢復，吃兵糧丸可以加倍恢復效果。
在遊戲開始前，玩家需要創建角色，包括選擇頭髮和護額的顏色、髮型、勢力（如木葉村）等。
遊戲中還增加了許多動作，如忍者跑和發動忍術時的特殊動作。不過，這些動作可能不會在安裝了高清修復模組的情況下顯示。
此外，玩家在生存模式中使用忍術時會消耗經驗值。如果遊戲載入緩慢，可以嘗試卸載谷歌商店後再次進入遊戲。