自製的手工曲奇由於沒有添加防腐劑和其他添加劑，其保質期通常為15-30天，前提是必須密封保存在陰涼乾燥處。如果是在市場上購買的手工曲奇，保質期則可能因添加了防腐劑等添加劑而延長，一般可以維持半年到一年。不同品牌的曲奇可能有不同的保質期，例如藍罐曲奇的保質期通常在6個月至1年左右。另外，一些特定品牌的手工曲奇，如迦南的，可以保存60天。
不同類型的曲奇也有不同的保存時間。常溫下保存的曲奇需要放在密封的罐子裡，通常可以保存1-2周。如果密封並放入冰櫃冷凍，可以保存2個月。不過，再次食用時需要提前回溫，並注意避免受潮。此外，某些曲奇配方製作的曲奇在密封容器中可以保存一周左右，但如果密封冷凍保存，則可以存放更久。
綜上所述，手工曲奇的保質期取決於是否添加防腐劑、保存條件以及曲奇的類型。自製曲奇的保質期較短，一般為15-30天，而市面上添加了防腐劑的手工曲奇保質期可以延長至半年到一年。不同類型的曲奇在常溫或冷凍條件下的保存時間也有所不同。