政府公函的格式通常包括以下幾個部分：
首部。包括標題和主送機關。標題一般由發文機關名稱、事由和文種構成。主送機關是受文並辦理來函事項的機關單位，於文首頂格寫明全稱或規範化簡稱，其後用冒號。
正文。正文結構一般由開頭、主體、結尾、結語等部分組成。
開頭。用於說明發函的緣由，包括髮函的目的、根據、原因等，然後用「現將有關問題說明如下：」或「現將有關事項函復如下：」等過渡語轉入下文。
主體。這是函的核心內容部分，用於說明致函事項。函的事項部分內容單一，一函一事，行文要直陳其事，用簡潔得體的語言把需要告訴對方的問題、意見敘寫清楚。
結尾。一般用禮貌性語言向對方提出希望，如請協助解決某一問題，或請及時復函，或請提出意見等。
結語。根據函詢、函告、函商或函復的事項選擇運用不同的結束語，如「特此函詢（商）」「請即復函」「特此函告」「請主管部門批準」等。
尾部。包括署名和成文時間兩項內容。署名機關單位名稱，寫明成文時間年、月、日，並加蓋公章。
公函的語言要求規範、明了，語氣要符合內容要求。在寫作時要注意一事一函的原則。