製作新疆羊肉串的過程涉及切割羊肉、醃製、串肉和烤制幾個步驟。以下是詳細的操作過程：
切割羊肉。選擇肥瘦相間的羊肉，切成2至3厘米大小的塊狀。
醃製羊肉。將切好的羊肉放入大碗中，加入適量的鹽、孜然粉、辣椒粉、黑胡椒粉、大蒜粉和生薑粉等調料，攪拌均勻，讓調料充分滲透。醃製時間一般需要2至3個小時。
串肉。將醃製好的羊肉塊用竹籤或鐵釺串起來，注意肥瘦相間，以便烤制時肉質更加多汁。
烤制。可以選擇炭火或烤箱烤制。如果使用炭火，注意控制火候，避免肉烤焦；如果使用烤箱，預熱至200度左右，將羊肉串放入烤箱中烤制約10至15分鐘，期間需不斷翻面以確保均勻受熱。
調味。在烤制過程中或烤好後，可再撒上適量的孜然粉、辣椒粉等調味料以增加風味。
完成。烤至羊肉表面金黃，香味四溢即可取出享用。
根據個人口味，可以在醃製和烤制過程中添加或調整某些調料，如辣椒油、蛋清、澱粉等，以改變羊肉串的口感和風味。