日式芝士蛋糕的製作方法如下：
預熱烤箱至130度。將3顆雞蛋分離，蛋清放入乾淨的碗中，蛋黃備用。將蛋清冷凍至稍微結冰。
將奶油芝士坐在熱水中加熱，加入黃油和牛奶，攪拌均勻至順滑。
篩入低筋麵粉，攪拌均勻至無乾粉。加入蛋黃，混合均勻。
將冷凍的蛋白加入幾滴檸檬汁，用中高速打發至出現大尖勾，然後轉為低速調整。
將蛋白霜倒入芝士糊中，用刮刀翻拌均勻。
將麵糊倒入模具中，輕震模具以排出大氣泡。
將模具放入預熱好的烤箱中，烘烤約50分鐘。然後將上火調至150度，將蛋糕表面烘烤上色，大約10分鐘。
關閉烤箱後，讓蛋糕在爐內靜置一會兒，然後取出，讓其自然冷卻。
日式芝士蛋糕的製作過程相對簡單，但需要注意細節，以確保蛋糕的口感和外觀。