日本通常被認爲是三個著名的古都，分別是：
京都：位於日本西部近畿京都府南部，是日本的古都，也是日本的政治、文化和歷史中心之一。京都以其衆多的歷史建築和文化遺產而聞名，包括金閣寺等。
奈良：位於日本紀伊半島中央，是日本的古都之一，也是日本歷史和文化的發祥地之一。奈良以其古老的寺廟和公園以及與自然和諧共存的傳統而著稱。
鎌倉：位於神奈川縣相模灣北岸的三浦半島西部，是日本的古都之一，也是日本中世紀初期的政治中心。鎌倉以其衆多的歷史建築和寺廟而聞名，包括圓覺寺、鶴岡八幡宮等。
其他提到的城市如大津、逗子、橿原、明日香、櫻井、天理、斑鳩、東京、大阪、出雲、松江、名古屋、長崎、福岡、金澤、那霸、神戶和堺雖然都是日本的重要城市，但它們並不被普遍認爲是古都。