櫻花和花菖蒲
日本的市花有兩種，分別是櫻花和花菖蒲。
櫻花（桜，sakura）是日本文化的重要象徵之一，代表著美麗、覺醒以及短暫性。櫻花時節是日本年曆中最熱鬧的一段日子，標誌著春日的開始。人們常說的日本櫻花指的是「染井吉野」以及其它日本的本土櫻花品種。同時，櫻花也是東京的市花。
花菖蒲（Hanashobu），原為日本佐原市的市花，在日本已經有500多年的栽培歷史，是日本著名傳統觀賞植物之一。它是由鳶尾屬玉蟬花（Iris ensata）選育獲得的一個鳶尾園藝品種群，國際上又稱之為日本鳶尾（Japanese Irises）。花菖蒲傳統分類一般是根據產地不同分為4個品系，包括江戶系列、伊勢系列、肥後系列和長井系列。在上個世紀中期，為了獲得黃色系的花菖蒲，日本雜交育種學家們將花菖蒲與黃菖蒲進行種間雜交獲得了一類新的鳶尾，因此類鳶尾中多數品種垂瓣基部的黃色花斑周圍具有紫色暈圈，故有雅名「眼影鳶尾」。