日本的扣稅計算方式如下：
應稅所得額的計算。這是計稅的基礎，等於納稅人的全部所得額減去爲取得所得所發生的必要費用和稅法規定的扣除額。
扣除項目。主要包括其他損失扣除、醫療費扣除、社會保險費扣除、小規模企業互助存款扣除、生命保險費扣除、損失保險費扣除、捐贈款扣除、傷殘者扣除、老年人扣除、遺孀扣除、學生扣除、配偶扣除、撫養扣除、基礎扣除等。這些扣除通常有具體的扣除限額。
所得稅率。根據年收入的不同而有所不同，例如，年收入195萬日元以下稅率爲5%；330萬日元以下爲10%；695萬日元以下爲20%；900萬日元以下爲23%；1800萬日元以下爲33%；1800萬日元以上爲40%。
特殊扣除。如捐贈款扣除的計算公式爲特定捐贈款合計金額－1萬日元，或者（年收入金額×25%）－1萬日元，取較少金額作爲扣除標準。
稅收徵管。日本實行源泉徵收制，對於在公司工作的納稅人，如果無兼差或副業，公司通常會代爲申報並扣繳稅款。如有副業或其他收入，則需自行申報並繳納相應的稅款。
這些信息提供了關於日本扣稅計算的全面概述，但請注意，具體的扣稅細節可能因個人情況而異。