日本花粉症的主要原因是由於戰後為了增強綠化覆蓋率而大量種植的杉樹和柏樹。這些樹木在春天產生大量的花粉，由於日本山地多，這些花粉隨風飄散在城市和鄉村地區。城市化的進程中，地面被大量水泥和瀝青覆蓋，導致花粉無法被自然吸收，加上汽車尾氣等人為因素，使得花粉在城市中積聚，難以消散。
當花粉濃度達到一定水平時，就會對人體造成過敏反應，引發花粉症。這種病症主要表現為眼部發癢、流淚、眼瞼紅腫、鼻腔發癢、噴嚏、水樣分泌物增多等症狀。日本花粉症的發病率高，部分原因是由於飲食和生活環境的改變導致了過敏體質的人群增多。