日本的黑道組織主要有以下幾個：
山口組：山口組是日本最著名的黑社會組織之一，成立於1915年，是日本乃至全球最具影響力的黑幫組織之一。山口組的本部位於兵庫縣神戶市，是日本規模最大、收入最高的暴力團伙。現在當家的是六代目司忍，他在2005年就任六代目山口組組長，被警察署列爲“極其危險的人物”。
稻川會：稻川會本部位於東京都港區六本木，截止2015年年末的統計，約有5800名成員。
住吉會：住吉會本部位於東京都港區赤坂，截止2015年年末的統計，約有7300名成員。
以上三個組織都是日本合法化的黑幫，他們在國內並不怎麼幹壞事，但到了國外就無惡不作。