昆明三日游的推薦行程如下：
第一天，早上遊覽翠湖公園，然後前往陸軍講武堂和雲南大學，下午參觀雲南省博物館，晚上可以在斗南花市購買鮮花。
第二天，早上前往西山公園，遊覽茶馬花街和聶耳墓，下午參觀海埂大壩，晚上回到市區，可以在同德昆明廣場體驗雲南菜。
第三天，上午報名參加石林和九鄉的純玩團，下午返回市區，晚上在同德廣場購物中心逛一圈，品嘗菌彩野生菌火鍋。
此外，昆明美食推薦包括鮮花餅、過橋米線、三七汽鍋雞和野生菌火鍋等。住宿方面，推薦住在白雲路捷運站附近的設宿民宿，交通便利且生活設施齊全。以上行程僅供參考，具體可根據個人興趣和體力進行調整。