昆明市擁有多所高等教育機構，其中包括：
雲南大學。這是一所全國重點大學，位於昆明市，是「雙一流」建設高校和211工程重點建設高校，以生物多樣性保護、民族學、生態學等學科領域著稱。
昆明理工大學。位於昆明市，是另一所全國重點大學，以工科為主，同時在材料科學、化學等學科領域有顯著優勢。
雲南師範大學。這是一所綜合性大學，以師範教育為主體，同時也涵蓋工、理、管、文、法等多個學科。
雲南財經大學。位於昆明市，以經濟學、管理學為主，同時涵蓋工、理、法、教育、藝術等多學科。
昆明醫科大學。這是一所以醫學為主體，涵蓋工、理、管、文、法等多學科協調發展的高校。
雲南農業大學。位於昆明市，是一所以農業為主的綜合性大學，擁有優秀的農業師資力量和實驗設備。
雲南民族大學。位於昆明市，是一所具有民族特色的綜合性大學，擁有豐富的民族文化和優秀的教師隊伍。
西南林業大學。位於昆明市，是一所以林學為主的綜合性大學，擁有豐富的森林資源和優秀的林業師資力量。
此外，昆明市還有多所民辦高校和職業技術學院，如昆明城市學院、昆明文理學院、雲南林業職業技術學院等，為昆明市的高等教育領域增添了多樣性。