普渡公的拜祭方式主要有以下幾種：
三案式：分爲上案（地藏菩薩、觀音菩薩、地官大帝、救苦天尊與衆神佛）、中案（普渡真君）、下案（好兄弟）。一共擺放三張神案，紙錢、祭品各異。此種儀式繁瑣，最爲虔誠。
兩案式：僅供奉普渡真君（普渡公）神案、好兄弟神案。這是折衷的結果。
一案式：先祭祀完普渡真君，燒完四色金紙後，再呼請好兄弟加以祭拜。
一案兩爐式：壇首擺放普渡真君香爐，壇中擺放好兄弟香爐。先向真君頂禮，拜完後再拜好兄弟的香爐。
在臺灣民間信仰，普渡的擺桌祭拜，又分成“公普”（又稱“聯普”，全聚落、團體或廟境居民聯合舉辦）與“私普”（個人或單一家庭、機關舉辦）。
普渡舉辦時，供桌上也會豎立彩色三角形紙旗，號稱“普渡旗”，該旗以毛筆寫上“慶贊中元”、“廣施盂蘭”、“敬奉陰光”、“冥輝普照”等“中元敬語”，也會寫上信士姓名。
先祭拜統領萬姓幽靈的普渡真君，並焚燒四色金紙。燒完金紙後，開始祭拜所謂的“好兄弟”，並在每一項供品插上一炷香，也會在供桌下放置香皂、毛巾與盛滿清水的面盆供“好兄弟”梳洗，此時有的人會先燒“經衣”，這是一種代表衣物與日用品的紙錢，讓“好兄弟”們先換上新衣。許多抽菸者，還會點燃香菸，插在香腳上，推己及“魂”，供“好兄弟”吞雲吐霧，別有一種人情味。祭拜完後，焚燒銀紙，歡送衆家“好兄弟”離開。