使用暖箱的方法主要包括以下幾個步驟：
檢查暖箱。在使用前，需要檢查暖箱是否完好，確認沒有損壞，確保電線和接線沒有破損，水槽內加入適量的蒸餾水。
接通電源並預熱。將暖箱接通電源，進行預熱，以達到所需的溫度和濕度，溫度和濕度應根據患兒的體重、出生日齡進行適當調整。
放置患兒。暖箱達到預定溫度後，需核對患兒信息，將患兒裸體（或穿單衣）裹好尿布放置於暖箱內，如果使用膚控模式，應將溫度探頭置於患兒腹部較平坦處，用膠布固定。
監測和調節。定時測量患兒體溫，根據體溫情況調節暖箱溫度，並做好記錄，在患兒體溫未升至正常之前應每30~60分鐘監測1次，體溫正常後可每1~4小時測1次。
護理操作。在暖箱內進行所有必要的護理操作，如餵奶、換尿布、清潔皮膚、觀察病情等，操作時應儘量減少開門次數和時間，以免影響箱內溫度。
出箱條件。患兒體重達2000g或以上，體溫正常，或者患兒在溫箱內生活了1個月以上，體重雖不到2000g但情況良好，可在室溫24~26℃的情況下，穿單衣在32℃暖箱內能維持正常體溫。
清潔消毒。使用後的暖箱需要進行清潔消毒處理。