曹元忠是清代著名的文學家和經學家，他的著作集包括但不限於以下幾部：
《箋經室遺集》：這是曹元忠的文集，共20卷，由王大隆編撰。
《司馬法古注》：這是曹元忠在經學方面的著作。
《荊州記》輯本：曹元忠對古代文獻進行了輯錄。
《樂府補亡》：曹元忠在文學方面的作品。
《蒙韃備錄校注》：這是曹元忠對古代文獻的校注。
《顧黃王三儒從祀錄》：曹元忠在歷史文獻方面的研究。
此外，曹元忠還有其他著作，如《宋元本古書證》、《桂花珠叢》、《賜福堂詩詞稿》、《學志》等。他的生平事跡和更多著作信息可以在曹元弼的《君直從兄家傳》中找到。