《月下夜想曲》中的半妖精故事主要講述了主人公莉娜是一個半妖精，她有著人類和妖精的混合血統，從小生活在森林中，與妖精們建立了深厚的友誼。然而，當莉娜的母親被人類社會視為異類並受到迫害時，莉娜也開始遭受到人類的敵視和攻擊。她渴望與人類建立平等的關係，卻遭到了無盡的挑戰和危險。最終，莉娜被迫背井離鄉，尋求新的生存之道。在遊戲過程中，玩家需要與半妖精夥伴們合作，打敗敵對的人類勢力，幫助莉娜實現自己的夢想，並在面臨新的挑戰和機遇時做出自己的選擇。整個故事圍繞著莉娜和她的命運展開，展示了一個充滿奇幻色彩的世界和各種角色的命運交織。