朱紫圖鑑獎勵主要包括以下幾個方面：
基本獎勵：
收集到100個圖鑑後，獎勵包括三個星星和沙子。
收集到100級後，獎勵包括三個糖果和十個先機球。
每多收集十個圖鑑，就會多一個獎勵，具體包括高級球、經驗糖果、先機球等。
特定圖鑑獎勵：
收集到30個圖鑑後，獎勵包括兩種高級球。
收集到200個圖鑑後，獎勵包括先機球20個。
收集到400個圖鑑後，獎勵包括閃耀護符（提升出閃率）、證書。
圖鑑界面獎勵：
按減號「➖」鍵打開圖鑑按「X」鍵即可獲得獎勵。每收集十個寶可夢圖鑑，都有獎勵，獎勵有各種經驗糖果、彗星碎片、稀有精靈球，比如月亮球、夢境球、究極球等。
限定寶可夢：
寶可夢朱和紫都分別有23種不同的限定寶可夢。想要收集全400隻，需要跟不同版本的好友交換，或者購買兩個版本的遊戲。
特殊獎勵：
領完全部圖鑑獎勵後，回到學員找生物老師，他會給你一個閃耀護符！可以將之後遭遇精靈的閃光率提升3倍，從大約1/4000提升到1/1333左右。
以上獎勵中，特別值得一提的是究極球，它在遊戲裡非常珍貴，只有在收集到400個圖鑑後才能獲得。此外，閃耀護符也是一個非常重要的獎勵，它能大大提升遇到閃光寶可夢的機率。