《杜心五傳奇》講述了清末武林怪傑杜心五的傳奇人生故事。
該劇講述了杜心五年輕的時候在湘西大鏢局因一次意外被胡彪、魏勝吸納成為武當門徒，與各路高手較量，進入內殿獲取真傳，最終成為一名反清武術家的人生經歷。在當時風雨飄搖的清末時代，杜心五見證了清王朝的覆滅，他與慈禧太后進行生死搏鬥，誓死保衛光緒皇帝，與革命黨人並肩作戰，最終與洪門結盟反清，走上保家衛國的道路的故事。
同時，該劇也展現了杜心五與劉九離婚後與各色人物交往的故事，如與苗人龍、羅漢等人的恩怨糾葛，與方飛燕的師徒情深等。劇中他經歷了無數的生死較量、愛恨情仇，從一個初出茅廬的青年逐漸成長為一名反清武術家。