根霉的菌落特徵如下：
菌落外觀。根霉的菌落疏鬆或稠密，最初呈白色，隨後變為灰褐色或黑褐色。其菌絲匍匐爬行，無色。
假根和孢囊梗特徵。假根發達，分枝呈指狀或根狀，呈褐色。孢囊梗直立或稍彎曲，2至4株成束，與假根對生，有時膨大或分枝，呈褐色，長210至2500微米，直徑5至18微米。
孢子囊特徵。孢子囊呈球形或近球形，老後呈黑色，直徑60至250微米。孢囊孢子呈橢圓形、球形或其他形狀，呈黃灰色，直徑5至8微米。
有性生殖和無性生殖。有性生殖時產生接合孢子囊，無性生殖時產生芽孢子。
此外，根黴菌落生長速度快，初期為白色棉花樣菌絲充滿斜面，之後變為深灰色。