植物的分枝方式主要有以下三種：
單軸分枝。這是植物分枝的主要方式之一，特別是在裸子植物和部分被子植物中較為常見。在這種分枝方式中，主幹由頂芽不斷向上生長形成，而各級分枝則逐漸細短，樹冠呈尖塔形。
合軸分枝。這種分枝方式中，主幹的頂芽生長到一定時期後，生長遲緩或停止，隨後由頂芽下部的腋芽代替頂芽生長，形成新枝，並取代主莖的位置。新枝的頂芽隨後也可能停止生長，由旁邊的腋芽繼續代替，以此類推，形成曲折的枝幹。
假二叉分枝。這種分枝方式常見於具有對生葉的植物，如石竹、丁香等。在頂芽停止生長或分化為花芽後，其下方的兩個側芽同時發育形成二叉狀分枝。
此外，還有一些特殊的分枝方式，如分櫱，主要見於禾本科植物，如小麥和水稻。分櫱是指植物在地面以下或近地面處發生的分枝，能夠增加植物的營養面積和產量。