《死亡愛麗絲》的輝夜故事主要講述了主人公愛麗絲在異世界中發生的故事，其中包括了她與輝夜公主的角色轉換，以及她和異世界角色們的交流等情節。具體故事內容如下：
在強烈的好奇心驅使下，愛麗絲從學校的天台跳入異世界中。在這個神秘的王國里，愛麗絲邂逅了神秘的輝夜公主，兩人建立了奇妙的心靈感應。作為大逃殺參賽者的愛麗絲得到了情報：“活下去”，此處的地名指向通往“黃昏森林”的道路，還教了她多種攻擊魔法和自我防身的魔法。在不斷變強的過程中，愛麗絲髮現與她心靈相通的輝夜公主竟變成了王國的最高權力者“王”，即身份地位發生巨大變化。愛麗絲從自身角度看待公主的人生觀、欲望以及命運的變化，同時也見證了“活下去”的意義與可能性。
因此，《死亡愛麗絲》中輝夜的故事揭示了角色愛麗絲在異世界中的成長與變化，同時也呈現了輝夜故事中角色的命運與觀念的轉變。這個故事展示了一個神秘世界中的角色們如何通過彼此交流和理解，尋找生存的意義和可能性。