水利站的主要職責包括：
宣傳和執行國家、省、市、縣各級政府的涉水法律、方針政策，依法治水、管水。
制定水利建設總體規劃、中長期發展規劃和年度計劃，包括防洪、排澇、節水、水資源保護、水土保持、河道整治等專業規劃。
統一管理水資源（地表水、地下水），負責農業、工業、生活用水的計劃制定和節水管理。
管理和保護水利設施、水域及其岸線，組織和指導河道、湖泊的綜合治理和開發。
負責水利基本建設的建設與管理，指導農村水利工作。
組織水土保持工作，監測和綜合防治水土流失。
推廣節水、節能和水土保持的先進經驗及科技成果，開展技術革新和科學試驗。
承擔防汛抗旱日常工作，組織協調全鎮的防汛抗旱工作。
此外，水利站還承擔其他相關職責，如制定節約用水政策、編制節約用水規劃、制定節約用水措施等，以及完成上級政府和業務部門交辦的其他工作。