水草的繁殖方法主要有以下幾種：
根部繁殖。一些水草的根部會生出側芽，這些側芽長大後與母體分離，形成新的個體。
莖部繁殖。對於有地下莖的植物，可以通過斷枝或側枝分離形成新的植株。地下莖可以從根部生出，在底砂中蔓延，每節可以生出新的植株。匍匐莖，類似於地下莖，但在砂面上繁衍。
葉子繁殖。將水草的葉子種植在底砂中，它們可以發展成完整的水草。
有性繁殖和無性繁殖。有性繁殖通過開花傳粉、授精結籽的過程完成。無性繁殖主要是營養繁殖，包括根部、莖部和葉子繁殖。
簡單人為法。根據水草的特性，人為地將根、莖、葉片切成需要的小段，埋在沙中使其發芽生根。
組織培養法。適用於名貴水草的快速繁殖。使用富含營養的培養基代替沙土，繁殖速度比簡單人為法快幾倍。
除此之外，還有一些特別的繁殖方法，例如苔蘚水生植物的孢子繁殖，這需要適宜的環境條件，如清潔的水質、適宜的光照和溫度。在繁殖水草時，還需要注意水草土壤的選擇、水草的剪枝和修剪方法、水草缸的光照和溫度要求等因素。