永恆之沫3.0二周目的攻略如下：
前往釜炎，乘坐纜車至煙突山，在勝利殿堂捕捉比克提尼，擊敗赤岩松後前往琉璃市，擊敗水梧桐後捕捉瑪娜菲。
前往茵郁市，在王者洞穴捕捉超夢，擊敗板木老大。
前往送神火山，捕捉騎拉帝納。
前往對戰開拓區，與魁奇思對話後捕捉雷姆。
回到琉璃市，在覺醒神殿深處捕捉阿爾咒斯，捕捉前需清空所有大師球。
前往橙華森林，捕捉雪拉比，並與火箭隊殘黨戰鬥。
到達煙囪山山頂，捕捉神獸。
前往茵郁市，捕捉超夢。
前往送火神山，進入反轉世界，捕捉冥王龍。
進入對戰區下方的山洞，捕捉神獸。
最後進入創世神殿，捕捉阿爾宙斯。