海洋微生物在海洋生態系統中發揮著極為重要的作用，主要包括以下幾個方面：
促進物質循環。海洋微生物通過分解作用將有機物質轉化為無機物質，如氮、磷等營養元素，從而促進物質的循環和海洋生態系統的生產力。
參與海洋物質生產、傳遞、沉降、分解和轉化的過程。海洋微生物通過這些過程為海洋植物提供良好的生存環境和資源，同時維持海洋生態系統的平衡和穩定。
維持食物鏈。海洋微生物作為海洋食物鏈中的重要環節，為許多海洋生物提供食物來源。
參與能源轉化。具有光合作用的微生物能將簡單無機物轉化為有機物和氧氣，為其他生物提供能量和營養。
提供抗生素和其他生物資源。海洋微生物的研究和利用對於新藥物的開發和生物資源的探索具有重要意義。
總的來說，海洋微生物在海洋生態系統的能量流動、物質循環、維持食物鏈穩定以及提供生物資源等方面發揮著不可替代的作用。隨著科學研究的深入，對海洋微生物的了解將更加全面，其在環境保護、生物資源開發等方面的潛力將得到更充分的發揮。