海洋中的稀有生物種類繁多，以下是一些例子：
白化鯨。這是一種極為罕見的鯨魚，其顏色完全為白色，已知的僅有一隻名為Migaloo的個體。這種鯨魚非常難以探測，估計在4萬隻鯨魚中才會出現一次。
小海牛。這是一種非常稀有且動作緩慢的海牛科動物，估計野外僅存不到10隻，可能甚至只有5隻。這種動物因其獨特性而被認為是不尋常的。
加布林鯊。這種生活在深海里的鯊魚，其皮膚呈半透明狀並呈粉紅色，擁有高級的電感受器系統，以一種類似「真空吸塵器」的方式進食。
長尾鯊。這種鯊魚以其長尾巴而聞名，使用尾巴發出聲音來捕捉獵物。
皺鰓鯊。這種深海魚類，因其古怪的牙齒而被稱為「活化石」，有300個牙齒呈27排。
此外，還有儒艮、中華白海豚、中華白鱘、紅珊瑚、庫氏硨磲、多鰓孔舌形蟲、黃島長吻蟲、鸚鵡螺、短尾信天翁、白鸛、黑鸛、玉帶海雕、白尾海雕、白腹軍艦鳥等也是國家一級或二級保護動物。這些物種的稀有性主要是由於自然環境破壞、氣候變化、過度捕撈和污染等因素造成的。保護這些物種對於維護海洋生態系統的健康和生物多樣性至關重要。