珊瑚白化是一箇複雜的現象，主要原因包括：
海水溫度升高。這導致珊瑚體內的微型海藻（共生藻類）大量死亡，進而使珊瑚褪色變白。
海水鹽度變化。低鹽度會影響珊瑚的生長與分佈，而快速的鹽度變化也可能導致珊瑚白化。
環境污染。包括過度捕魚、使用有害化學物質等，這些都對珊瑚構成威脅。
紫外線輻射增強。可能導致珊瑚組織受損，進而影響共生藻類的生存。
病毒感染。某些病毒可能與珊瑚白化有關，尤其是在水溫升高時，這些病毒可能在珊瑚內部大量增殖。
全球二氧化碳濃度升高。導致海水變酸，這對珊瑚構成災難性後果。
此外，珊瑚白化還可能與營養供應不足、海水透明度減弱等因素有關。