《漢宮秋》的故事大綱如下：
* 漢元帝時，北方匈奴入寇，宣帝至五原定邊。次年，漢元帝在灞橋與匈奴官員交涉，被鞮侯單于扣押。
* 漢元帝被囚禁在秋夜的草原上，看著月亮和星辰，思念故鄉。他吹起胡笳曲，感懷身世，抒發思念親人、愛妃之情。
* 此時，王昭君前往塞外探望姐姐時聽到曲調，被感動後求皇后令三閭大夫毛延壽獻其畫像。
* 毛延壽貪財畏死，見漢室將亂，昭君不能歸還，故意在畫像中將昭君畫醜。漢元帝按圖召幸之時，王昭君已許配給呼韓邪單于。
* 漢元帝後悔不已，但為時已晚。王昭君只好出塞嫁給呼韓邪單于。幾年後，匈奴主動結束與漢朝的聯盟，且欲歸順漢朝。匈奴主動遣使送還王昭君。
《漢宮秋》是一部關於“昭君出塞”的歷史故事，描繪了悲慘的歷史背景下人物命運的變遷。