勵志

勵志人生知識庫

火山圖怎麼看

火山圖(Volcano Plot)是一種常用於展示基因表達蛋白質組學或其他高通量數據分析結果的圖形。它有助於快速識別那些在統計上顯著變化且變化幅度較大的數據點。解讀火山圖時,可以關注以下幾個方面:

座標軸

橫軸通常表示變化倍數(Fold Change),以log2轉換後的值展示,點越偏離中心,表示差異倍數越大。

縱軸表示顯著性水平,通常是-log10轉換後的P值(adjusted P-value),點越靠圖的頂部,表示差異越顯著。

點:

圖中的每個點代表一箇檢測到的基因、蛋白質或其他分子。

點的顏色、大小和形狀可能代表不同的屬性,如上調、下調或無顯著差異,這些通常會在圖例中說明。

閾值線

火山圖中通常會有兩條或更多的閾值線,用於篩選出在統計上顯著且變化幅度較大的數據點。

橫軸上的閾值線表示變化倍數的閾值,如Fold Change > 2或< 0.5。

縱軸上的閾值線表示顯著性水平的閾值,如adjusted P-value < 0.05。

關注區域:

位於火山圖右上角的點表示顯著上調的數據點。

位於左下角的點表示顯著下調的數據點。

位於中間區域的點表示變化不顯著或變化幅度較小的數據點。

綜上所述,通過關注火山圖的座標軸、點、閾值線和關注區域,可以直觀地瞭解哪些數據點在統計上顯著且變化幅度較大,從而有助於進一步的分析和驗證。需要注意的是,不同研究或文章中火山圖的繪製和解讀可能略有差異,因此最好結合具體的文獻或研究背景進行解讀。