火車票過期後的處理方法取決於具體情況。如果火車票是因爲網絡延時顯示過期，或者車票已經售空，或者在車票下單的30分鐘內沒有付款導致自動取消，用戶可以退出重新查詢，出現新的信息後重新下單並儘快支付，以避免在車票下單的40分鐘內沒有付款自動取消的情況。如果車票過期是因爲所使用的購票軟件出現問題，可以嘗試卸載後重新下載，或者更換購票軟件。如果這些方法都不可行，可以直接撥打車站電話諮詢，或者讓車站工作人員幫忙購票。
如果是因爲特殊情況導致必須退票，可以在列車發出後的兩個小時內，經購票地車站或票面乘車站的站長同意後辦理退票。過期的火車票雖然不能退款，但可以免費改簽，只能改簽一次，且只能改簽至所買的車次之後24小時以內的其他車次。已取票的需要到起始站的火車站的售票窗口進行改簽手續，未取票的可線上改簽。
如果需要換取過期車票，可以在車票所載明的乘車日期起至31天內，到車站售票窗口換取車票，不收取任何服務費。如果在鐵路客票代售點窗口換取車票，每張車票會收取5元客票銷售服務費。
如果用戶需要報銷憑證，可以使用普通紙質車票作爲報銷憑證。在12306.cn網站購票且需要報銷憑證的旅客，可以於乘車前在車站售票窗口、鐵路客票代售點或自動售（取）票機換取普通車票。