三色貓通常都是母貓，這是因爲貓的毛色遺傳與性別染色體有關。在貓的性別決定中，雄性貓（公貓）擁有XY染色體，而雌性貓（母貓）擁有XX染色體。毛色基因主要位於X染色體上，其中橙色和黑色基因分別位於不同的X染色體上。因此，母貓有兩個X染色體，可以同時擁有橙色和黑色的基因，再加上常染色體的白色背景，從而呈現出三種顏色。而公貓只有一箇X染色體，通常只能表現出一種顏色，除非它們患有克氏綜合徵，這種罕見的遺傳疾病會導致公貓擁有兩條X染色體（XXY），從而可能出現三色表現。因此，三色公貓非常稀有，且通常患有克氏綜合徵。