關於呂宋島的名稱來源，有多種說法。一種說法是，漢高祖劉邦建立大漢政權後，指派老丈人呂氏家族的一名干將名叫「呂宋」的，帶領著三千族人前往南海尋找奇珍異寶。他們在島上休整補給生活物資，並在島上繁衍生息，久而久之，族人就把該島稱為「呂宋島」。另一種說法是，崖山戰役之後，元朝宣布統一中國。當時還有一部分宋朝殘餘勢力向南海遷徙，領頭人是南宋末代丞相陸秀夫的兒子陸自立，他把居住的島嶼稱為「陸復宋」島，後來由於歷代口音輾轉的緣故，變成了「呂宋」島。還有一種說法是，呂宋島馬尼拉灣入口處的海岬，岩石高峻，形如木杵，當地人稱為losung，故名呂宋。此外，還有說法認為島上的天然良港吸引了不少中國商船，因為島中曾有個小國叫呂宋，呂宋島因此得名。