種子會發芽是因爲獲得了發芽所需的基本條件，進而自然產生一系列生化反應。具體來說，這些條件包括：
充足的水分：當種子吸收到足夠的水分時，體積會膨脹，種皮和種仁變得溼潤。這使得種子內的胚乳或子葉開始進行生化活動，將澱粉轉化成糖，供胚根和胚軸利用。水分還能軟化種皮，爲胚芽出土創造有利條件。
充足的氧氣：種子在發芽過程中需要呼吸，就像人類需要氧氣一樣。種仁內的營養組織在酶的作用下開始分解轉化，如果氧氣不足，大部分種子會因缺氧而窒息腐爛。
合適的溫度：種子內部的生化反應需要在一定的溫度範圍內進行。溫度過低，種子無法萌發；溫度過高，種子可能會發黴腐爛。
當這些條件得到滿足時，種子內部的胚芽或子葉中的營養物質會被激活，催生胚根和胚芽生長，最終突破種子表皮破土而出。隨着時間的推移，幼苗逐漸發育成爲成熟的植物。