烤鴨和燒鴨主要的區別在於製作方法、選用的鴨子種類、食用方式、調味方法等方面。具體如下：
製作方法。烤鴨通常使用掛爐的方法烤制，而燒鴨則一般採用燜爐的方法。
選用的鴨子種類。烤鴨多選擇脂肪厚的“鴨苗”，也就是北京填鴨，而燒鴨則多選用生長期較短的白毛幼鴨。
食用方式。烤鴨的喫法較爲講究，通常配有專門的切鴨師傅，將鴨肉片成薄片，與荷葉餅、蔥等配菜一起食用，而燒鴨則更爲隨意，可以直接食用或配飯。
調味方法。烤鴨在製作過程中通常不加調料，而是烤制完成後搭配甜麪醬等配料食用，燒鴨則在製作前會用多種香料和調料醃製，烤制時肚子內會塞入調料，烤制後通常搭配酸梅醬食用。