焦糖南瓜布丁的做法主要包括以下步驟：
製作焦糖液。將糖和水在大火上煮至沸騰，然後改用中火繼續煮至糖變色。輕輕搖晃鍋子，待泡沫變小且變成大泡時，加入熱水並離火。將焦糖液倒入布丁杯中。
準備南瓜。將南瓜蒸熟後去皮取果肉，壓成泥狀，並過篩以獲得更細膩的口感。
製作布丁液。將南瓜泥與牛奶、雞蛋混合攪拌均勻。可以加入一些白糖以增加甜味。
過濾布丁液。使用濾網過濾布丁液，去除粗糙的殘渣。
烤制布丁。將布丁液倒入小碗中，放入預熱至160度的烤箱中烤制約40分鐘。或者將布丁杯放在蒸架上煮至沸騰後續煮五分鐘，再放悶燒鍋中悶35分鐘。
製作焦糖表面。烤好的布丁表面撒上少量白糖，使用噴槍加熱至焦糖化，或者使用熱勺子底將白糖燙出焦感。
冷藏與食用。將烤好的布丁冷卻至室溫後放入冰櫃冷藏至少2小時，最好隔夜。食用前，可以將布丁從杯中倒出，即可享用。