琉球羣島在歷史上並非一直受日本管轄。以下是琉球羣島與日本關係的簡要概述：
歷史背景：
琉球羣島在公元前1000年左右形成了獨特的文化共同體。公元14世紀，琉球王國開始崛起，成爲一箇獨立的政治實體，並與中國、日本和東南亞等周邊國家建立了廣泛的聯繫。
琉球國在1609年開始受到日本的侵略，日本有計劃地實施吞併琉球的計劃。1879年，琉球國被併入日本版圖，並設置爲琉球縣（後改名爲沖繩縣）。
政治原因：
琉球羣島的戰略位置和經濟價值吸引了日本的注意。日本明治維新後，開始對琉球進行殖民統治，將其視爲擴張勢力的一部分。
1872年，日本通過外交手段迫使琉球開放對外貿易，實際上使琉球成爲日本的附屬國。
文化與名稱改變：
日本政府將琉球改名爲沖繩，這一行爲是基於政治和安全考慮，旨在鞏固對琉球地區的控制和統治。
改名行爲引發了廣泛的爭議，因爲對於琉球人民來說，琉球是一箇重要的文化和歷史概念。
國際法與主權爭議：
根據《波茨坦公告》，琉球主權重歸中國，但美國暫行託管琉球。1970年，美日揹着中國簽定《美日舊金山和約》，將琉球管理權轉給日本，這一行爲在法律上存在爭議。
儘管日本對琉球羣島有施政權，但其主權仍存在爭議。琉球人民和國際社會對日本的主權主張持保留態度。
綜上所述，琉球羣島與日本的關係複雜多變，涉及歷史、政治、文化和國際法律等多箇方面。儘管日本對琉球羣島有施政權，但其主權歸屬仍有爭議。