生物的命名方式主要是基於雙名法（binomial nomenclature），這是一種在生物學中廣泛使用的命名系統。根據雙名法，每個物種的科學名稱（即學名）由兩部分組成：屬名和種加詞（或稱種小名）。屬名是名詞，通常大寫，表示物種屬於哪個科；種加詞通常是形容詞，小寫，具體描述物種的特點。
此外，生物命名的原則還包括遵循分類學原理和方法，確保命名的準確性和一致性。例如，如果兩個物種以相似的方式利用同一有限的資源和能源，它們必定會發生競爭和相互排斥。
除了雙名法，還有其他命名方法，如單名法、三名法等，用於對不同分類單元進行命名。在某些情況下，也會以人名來命名新物種或行星，這通常是為了向科學家致敬。
在有機化合物命名中，也遵循類似的規則，但更注重取代基的順序和主鏈的選擇。