番石榴和石榴之間存在幾個主要區別：
科屬不同。儘管它們都屬於石榴科，但石榴屬於千屈菜科，而番石榴則屬於番石榴科。
外形和顏色。石榴的形狀通常為圓形或橢圓形，表面光滑，顏色多為鮮紅色或橙黃色；番石榴的外觀也呈圓形或橢圓形，但通常為青綠色，表面粗糙，帶有凸起的小點。
果肉和種子不同。石榴的果肉呈水晶樣小籽，內部充滿了一顆顆如寶石般璀璨的石榴籽；番石榴的果肉則是呈現出一種深黃色或淡黃色，內部並沒有像石榴那樣的籽，取而代之的是大量的類似於草莓一般的黑色小籽。
營養成分不同。石榴和番石榴都含有豐富的維生素C、維生素B、蛋白質、脂肪、糖類等營養成分，以及多種微量元素如鈣、鐵、磷等；番石榴還含有一種名為「番石榴甙」的物質，這種物質對於降低血壓、血脂具有很好的效果。而石榴還含有多種生物鹼和黃酮類物質，具有抗炎、抗氧化、抗癌等多種生物活性。
生長環境不同。番石榴主要生長在熱帶和亞熱帶地區，喜歡溫暖濕潤的氣候；石榴則生長在溫帶和亞熱帶地區，喜歡溫暖乾燥的氣候。
食用方式和藥用價值不同。番石榴可以直接食用，也可以榨汁飲用，或者製作成果醬、果乾等食品。石榴可以直接食用，也可以榨汁飲用，或者製作成果汁、果酒等食品。番石榴具有清熱解毒、收斂止瀉、生津止渴等功效，可用於治療泄瀉、痢疾、糖尿病等病症。石榴具有清熱解毒、收斂止瀉、活血化瘀等功效，可用於治療泄瀉、痢疾、痛經等病症。