碧藍航線長門的故事如下：
在歷史上，長門號戰艦是日本海軍的戰艦之一。在碧藍航線中，玩家扮演的指揮官與長門成為了好朋友，但是長門受到了其他船的排擠，這時指揮官決定幫她解決這一問題。於是指揮官通過改善長門的裝備，和她一起參與活動來提高知名度等等，幫助長門解決與其他戰艦差距過大，以及獲得大量支援的問題。隨著劇情的推進，兩人也從最初的新手引導朋友發展到形影不離的搭檔和家人。
在故事中，長門號戰艦成為了有感情、有情緒的角色，與指揮官之間建立了深厚的感情。同時，這個故事也描繪了指揮官與長門號戰艦之間的成長與改變，以及她們與其他角色之間的互動關係。
總的來說，碧藍航線中的長門是一個具有豐富故事的角色。