神仙眷侶的意思主要有以下幾個方面：
表面釋義：指兩個人都是神仙並且是夫妻，通常用來形容世俗中少見的、具有較高才情見識、關係非常默契的正式夫妻或男女。這種用法相對於“情侶”而言，更加側重於體現和諧的感情而非炙熱的情慾。
本意：神與仙之間美好的情侶關係。
現代意義：比喻甜蜜美好的戀情於夫妻或者是情侶之間的美好感情，是人人稱讚、爲人們所羨慕的關係很好的眷侶，兩人關係和睦，並且形影不離。與此同時，眷侶兩人都是有着美好品格爲世人所認可的。
其他含義：有時也用來形容夫妻不僅是生活上的伴侶，也是事業上的伴侶。
中國古代敬稱：是中國古代對恩愛夫妻的敬稱，夫妻恩愛就好似神仙一樣的愜意。
綜上所述，神仙眷侶是一箇多層次、多維度的成語，寄託了人們對於美好感情的嚮往和期待。